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李依明

助理教授

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李依明教授先后在上海交通大学、海德堡大学、卡尔斯鲁厄理工学院、 欧洲分子生物实验室总部和耶鲁大学等多个国际一流机构学习和工作,并取得了一系列突出的研究成果。以第一作者在Nature Methods,ACS Nano等国际权威期刊发表多篇论文。其开发的软件获得领域内权威挑战赛的第一名,赢得了广泛的声誉和影响力。目前和包括来自耶鲁大学,牛津大学和剑桥大学等多个实验室有合作关系。课题组将依托南方科技大学-悉尼科技大学生物医学材料与仪器联合研究中心,建立以超分辨成像平台为核心的,物理,工程,生物和化学等多学科交叉的一流显微成像实验室。

 

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教育背景
2010年-2015年 卡尔斯鲁厄理工学院应用物理系 博士
2009年-2010年 海德堡大学-医学物理硕士
2005年-2009年 上海交通大学-生物医学工程 本科

 

工作经历

预计2019.11 南方科技大学生物医学工程系, 助理教授
2016年-2019年 欧洲分子生物实验室海德堡总部,博士后

2016.02-2016.09 耶鲁大学,访问学者

 

荣誉及奖励
2013年 International Symposium on Biomedical Imaging Travel Grant
2010-2013年 Karlsruhe school of optics and photonics fellowship
2016-2019 年 EIPOD-Marie Curie Postdoc Fellowship

 

代表论文

1.Yiming Li, Yu-Le Wu, Philipp Hoess, Markus Mund, and Jonas Ries. Depth-dependent PSF calibration and aberration correction for 3D single-molecule localization. Biomed. Opt. Express, 6, 2708-2718, (2019)
2. Yiming Li, Markus Mund, Philipp Hoess, Joran Deschamps, Ulf Matti, Bianca Nijmeijer,Vilma Jimenez Sabinina, Jan Ellenberg, Ingmar Schoen, Jonas Ries. Real-time 3D single-molecule localization using experimental point spread functions. Nat. Methods, 15, 367-369, (2018)

3.Yiming Li, Li Shang, G. Ulrich Nienhaus. Super-resolution imaging-based single particle tracking reveals dynamics of nanoparticle internalization by live cells. Nanoscale, 8, 7423-7429, (2016)

4.Yuji Ishitsuka, Natasha Savage, Yiming Li, Anna Bergs, Nathalie Grün, Daria Kohler, Rebecca Donnelly, G. Ulrich Nienhaus, Reinhard Fischer, Norio Takeshita. Superresolution microscopy reveals a dynamic picture of cell polarity maintenance during directional growth. Science Advances, 1, e1500947 (2016)

5.Yiming Li, Yuji Ishitsuka, Per Niklas Hedde, and G. Ulrich Nienhaus. Fast and efficient molecule detection in localization-based super-resolution microscopy by parallel adaptive histogram equalization. ACS Nano 7, 5207–5214 (2013)

6.Shuo Chen, Xiaorui Feng, Yiming Li, Chuanqing Zhou, Peng Xi, Qiushi Ren. Software Controlling algorithms for the system performance optimization of confocal laser scanning microscope. Biomed. Signal Process Control 3, 223-228 (2010)

7.Thevathasan, J. V. et al.Nuclear pores as versatile reference standards for quantitative superresolution microscopy. Nat. Methods 16, 1045–1053 (2019).

8.Yongdeng Zhang, et al., Nanoscale subcellular architecture revealed by multicolor 3D salvaged fluorescence imaging. Nature Methods, Accepted.

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