近日,国家自然科学基金委员会公布了首批国家自然科学基金青年学生基础研究项目(博士研究生)立项名单,南方科技大学生物医学工程系2020级博士研究生傅爽(导师:李依明)申报的《数据与物理模型联合驱动的厚样品三维超分辨成像的关键问题研究》成功获批,资助经费30万元。
1. 获资助项目简介
单分子定位显微镜(SMLM)作为一种具有高分辨率(20-30 nm)和分子特异性的超分辨成像技术,近年来在生命科学的研究中取得多个重要发现。然而SMLM在受到系统像差、背景荧光以及样品像差的影响下分辨率会迅速下降,这也导致其观测深度通常局限于玻片表面数微米,极大限制了该技术的应用范围。本项目拟通过对原位矢量光场的理论建模和神经网络协同学习策略的研究,提出一种数据与物理模型联合驱动的变分自编码器算法。该算法可以从海量单分子数据中自适应学习包含未知像差的点扩散函数和荧光分子位置。结合自适应光学系统矫正复杂样品中的像差,本项目有望大幅提高SMLM的成像深度,拓宽超分辨成像的应用范围,为生命科学的研究提供新视角和新工具。
2. 项目负责人简介
傅爽,生物医学工程系2020级博士研究生,主要从事三维超分辨显微成像技术的研究。迄今以第一作者(含共一)在Nature Methods、Optics Letters、Optics Express等知名期刊上发表论文,获得博士研究生国家奖学金,参加多次学术会议并获得最佳口头报告奖。
3. 导师及课题组简介
李依明,南方科技大学研究员。2009、2010、2015年分别于上海交通大学、海德堡大学、卡尔斯鲁厄理工学院获得生物医学工程学士、医学物理硕士和生物物理博士学位。2016-2019年受玛丽居里博士后奖学金资助,分别在欧洲分子生物实验室和耶鲁大学任职博士后和访问学者。2019年底入职南方科技大学担任独立PI。研究方向为三维超高分辨显微成像技术及其生物应用。近年来以第一/通讯(含共同)发表多篇高影响力论文,包括Nature Methods(2018,2023,2024),Nature Communications(2022)等。主持了国自然面上、山东省重点研发计划、深圳市基础研究重点、深圳市医科委前沿探索等多个科研项目。目前和包括来自EMBL,耶鲁大学,牛津大学和剑桥大学等多个实验室有合作关系。课题组长期招收博士后、研究助理及博士/硕士研究生,有物理,光学工程、计算机、机械工程、生物医学工程、生物技术、生物化学等相关专业背景,要求具备良好的学习能力、独立工作能力和团队沟通能力。
课题组主页:https://li-lab-sustech.github.io/
有意者请将个人简历发送至李依明副教授邮箱:liym2019@sustech.edu.cn